Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl53Q9D1H8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms