Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zbed3Q9D0L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zbed3Q9D0L1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zbed3Q9D0L1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms