Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mdm1Q9D067 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mdm1Q9D067 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms