Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp1Q9CYR0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp1Q9CYR0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms