Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx7Q9CY18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx7Q9CY18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms