Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrps28Q9CY16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrps28Q9CY16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrps28Q9CY16 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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