Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms