Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed5Q9CXE7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed5Q9CXE7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms