Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd4Q9CWX4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms