Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cxxc1Q9CWW7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxxc1Q9CWW7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms