Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms