Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn3Q9CVD2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atxn3Q9CVD2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atxn3Q9CVD2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms