Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rprd1bQ9CSU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.6 ms