Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccer1Q9CQL2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccer1Q9CQL2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms