Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rwdd1Q9CQK7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rwdd1Q9CQK7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.2 ms