Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudt21Q9CQF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudt21Q9CQF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 446.8 ms