Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl11Q9CQF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl11Q9CQF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl11Q9CQF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms