Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap3bQ9CQE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms