Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1bQ9CQC9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1bQ9CQC9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms