Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scd3Q99PL7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scd3Q99PL7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms