Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NsmfQ99NF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NsmfQ99NF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NsmfQ99NF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NsmfQ99NF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms