Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl3Q99N95 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl3Q99N95 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl3Q99N95 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms