Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrrtQ99MR6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrrtQ99MR6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms