Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc12a9Q99MR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a9Q99MR3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a9Q99MR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a9Q99MR3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms