Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nus1Q99LJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms