Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clp1Q99LI9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clp1Q99LI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clp1Q99LI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms