Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dok4Q99KE3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms