Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pls3Q99K51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pls3Q99K51 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pls3Q99K51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms