Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TrabdQ99JY4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrabdQ99JY4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrabdQ99JY4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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