Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EpcamQ99JW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EpcamQ99JW5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EpcamQ99JW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms