Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn16Q925N4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn16Q925N4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn16Q925N4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms