Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trps1Q925H1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trps1Q925H1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms