Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csmd1Q923L3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csmd1Q923L3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms