Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrif1Q923B3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrif1Q923B3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrif1Q923B3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms