Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn1Q922Y1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubxn1Q922Y1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn1Q922Y1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms