Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb6Q922F4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb6Q922F4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms