Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FdpsQ920E5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms