Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc5a4bQ91ZP4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc5a4bQ91ZP4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc5a4bQ91ZP4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms