Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PccaQ91ZA3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PccaQ91ZA3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PccaQ91ZA3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms