Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps36Q91XD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps36Q91XD6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms