Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trex1Q91XB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trex1Q91XB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trex1Q91XB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trex1Q91XB0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trex1Q91XB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trex1Q91XB0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trex1Q91XB0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trex1Q91XB0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms