Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q91WD4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q91WD4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q91WD4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q91WD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q91WD4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q91WD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q91WD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q91WD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q91WD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q91WD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q91WD4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q91WD4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q91WD4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q91WD4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q91WD4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q91WD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q91WD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q91WD4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q91WD4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q91WD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q91WD4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q91WD4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q91WD4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q91WD4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q91WD4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q91WD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q91WD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q91WD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q91WD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q91WD4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q91WD4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q91WD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q91WD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q91WD4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q91WD4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q91WD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q91WD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q91WD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q91WD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q91WD4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q91WD4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q91WD4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q91WD4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q91WD4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q91WD4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q91WD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q91WD4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms