Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setd3Q91WC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd3Q91WC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd3Q91WC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms