Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx9Q91VH2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx9Q91VH2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms