Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps3Q91VB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hps3Q91VB4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps3Q91VB4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms