Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vps4aQ8VEJ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps4aQ8VEJ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4aQ8VEJ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms