Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt25Q8VCW2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt25Q8VCW2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt25Q8VCW2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms