Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajc28Q8VCE1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc28Q8VCE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms