Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kdm4cQ8VCD7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms