Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC19

Alas1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas1Q8VC19 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alas1Q8VC19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alas1Q8VC19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Alas1Q8VC19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms